Synchytrium endobioticum باعث بیماری زگیل سیب زمینی می شود. Synchytrium endobioticum یک انگل اجباری است که هیف تولید نمی کند بلکه اسپورانژیا تولید می کند که حاوی زئوسپورهای متحرک است. اسپورانژهای تابستانی دیواره نازک و کوتاه مدت هستند. آنها در بافت سیب زمینی تشکیل می شوند و باعث عفونت های جدید زئوسپور می شوند. هاگ های در حال استراحت (گاهی اوقات به عنوان اسپورانژی زمستانی، هاگ زمستانی، سوری استراحت یا سوری زمستانی نیز شناخته می شوند) دیواره ضخیم دارند و حتی در غیاب میزبان برای مدت زمان بسیار طولانی زنده می مانند. اینها را می توان در طول فصل رشد تولید کرد. آنها از تجزیه زگیل در خاک آزاد می شوند. تشخیص S. endobioticum هم مربوط به گیاهی است که ممکن است روی آن زگیل ایجاد شده باشد و هم به خاکی که ممکن است
هاگ های استراحت را حمل کنید
پاتوتیپ های (نژاد) متعددی در شرح داده شده است S. endobioticum . اینها با توجه به میزان بیماریزاییشان روی ارقام سیبزمینی متفاوت تعریف میشوند. پاتوتیپ ۱ (D1) اکنون به ندرت در اروپا گزارش میشود که سیبزمینی را آلوده میکند زیرا تعداد کمی از ارقام سیبزمینی به آن حساس هستند، ظاهراً به دلیل وجود مقاومت غالب در میزبان. سایر پاتوتیپها اکنون بیشتر در اروپای غربی گزارش میشوند و به ویژه در مناطق کوهستانی بارانی اروپای مرکزی و شرقی یافت میشوند. آنها همچنین در خارج از اروپا (به عنوان مثال در نیوفاندلند، کانادا و در بخش آسیایی ترکیه) یافت میشوند. مقاومت در برابر این پاتوتیپها نادر است، بنابراین کنترل آنها دشوارتر است. پاتوتیپهای غیر از ۱ (D1) از طریق بیماریزایی متفاوت برای ارقام خاص سیبزمینی متمایز میشوند، اما در غیر این صورت به نظر میرسد که بیشتر از پاتوتیپ ۱ (D1) با یکدیگر مرتبط هستند. اقدامات داخلی توصیه شده در EPPO کشورها نیاز دارند که پاتوتیپها شناسایی شوند.
هویت اسپورانژیا تابستانی یا هاگ در حال استراحت مشاهده شده در زیر میکروسکوپ را می توان با PCR معمولی تایید کرد.
و Real-time PCR. PCR معمولی بر اساس فاصلهگذار داخلی رونویسی شده ناحیه DNA ریبوزومی (ITS) است که پرایمر جلو به ITS1 و پرایمر معکوس به ITS2 آنیل میشود. PCR بلادرنگ Van Gent-Pelzer و همکاران. (2010) بر اساس ITS2 است. PCR بلادرنگ اسمیت و همکاران. (2014) که در اینجا توضیح داده شده است بر اساس ریبوزومی زیر واحد کوچک (SSU) است
DNA (18S rDNA). PCR بلادرنگ توسعه یافته توسط Bonants و همکاران. (2015) بر اساس یک پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی مرتبط با پاتوتیپ 1 (D1) (SNP) است که با استفاده از تجزیه و تحلیل کاهش پیچیدگی توالی های چندشکلی (CRoPS) شناسایی شده است. هنگام استفاده از مواد زگیل سیب زمینی، یک کنترل جداسازی مثبت داخلی که ژن COX گیاه را هدف قرار می دهد برای نظارت بر اثربخشی جداسازی DNA استفاده می شود. پاتوتیپ 1 (D1) را می توان از حداقل پاتوتیپ های 2 (G1)، 6 (O1) و 18 (T1) توسط PCR بلادرنگ متمایز کرد.
مرجع: بعد از ظهر 7/28 (2) Synchytrium endobioticum. EPPO پژوهشنامه، 47: 420-440. https://doi.org/10.1111/epp.12441




